Die Silvius-Magnago-Akademie ist innerhalb der Stiftung der Südtiroler Volkspartei angesiedelt. Der Stiftungsrat der Stiftung Südtiroler Volkspartei ist gleichzeitig der Rat der Silvius-Magnago-Akademie.
Vorsitzender
Der politisch Verantwortliche für die Silvius-Magnago-Stiftung ist vorübergehend der Vorsitzende der SVP-Fraktion im Südtiroler Landtag, Elmar Pichler Rolle. Er vertritt die Anliegen der Akademie im Stiftungsrat.